תוכנית "אקדמיה-כיתה" מציבה לעצמה יעד של  חיזוק השותפות בין האקדמיה לבין בתי הספר והמחוזות.

מטרת התוכנית היא לתת מענה לשלושה אתגרים מרכזיים:

1. קידום למידה משמעותית בכיתות על ידי הוראה של שני מבוגרים באותה עת;
2. שיפור ההכשרה של סטודנטים להוראה ושל הפיתוח המקצועי של המורים המנוסים;
3. פיתוח של מסלולי קריירה בשלבים שונים: החל בסטודנט, עבור במתמחה וכלה במורה מכשיר סטודנטים ובמדריך פדגוגי מטעם המוסד האקדמי.

התוכנית פועלת כיום ב-27 מוסדות מכשירים ובעשרה סמינרים חרדיים, ומשתתפים בה כ-1800 סטודנטים להוראה בכ-350 מוסדות חינוך שונים.